Inteligência Coletiva

.: Inteligência Coletiva :.
Uma inteligência distribuída por toda parte: tal é o nosso axioma inicial. Ninguém sabe tudo, todos sabem alguma coisa, todo o saber está na humanidade’. (
Pierre Lévy)

segunda-feira, 13 de agosto de 2012

Mudei para a avenida Open Source Bioinformatics

Com objetivo de ampliar os projetos mudamos para outro site.

http://opensourcebioinformatics.com

Colabore com projeto.

quinta-feira, 23 de setembro de 2010

Bioinformática - Montagem de genoma com AMOS

AMOS é um ferramenta para infraestrutura de montagem de genomas. É um software livre e de código aberto licenciado pela GNU/Linux.

AMOS é composto por três pacotes importantes:

* AMOScmp - Um comparativo de montagens;
* Minimus - Uma montagem básica para pequenas bases de dados;
* ABBA - Montagem impulsionada por sequencia de aminoácidos.

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segunda-feira, 2 de agosto de 2010

Bioinformática - PhyML: alinhamento de sequências nucleotídicas em ambiente paralelo

Por José Cleydson Ferreira da Silva
O PhyML é um software utilizado para se fazer estimativa e probabilidade filogênica em alinhamento de sequências nucleotídicas ou sequências de anino ácido. Atualmente está na versão 3.0, seu desenvolvimento teve participação de diversos cientistas de algumas universidades no mundo.

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segunda-feira, 19 de julho de 2010

Bioinformática - Instalação do Mr Bayes em ambiente paralelo

Por José Cleydson Ferreira da Silva
Um dos melhores softwares da área da bioinformática é o Mr Bayes. Seu maior dilema é o processamento em ambiente paralelo, portanto este documento relata a instalação do MrBayes em sua versão para processamento paralelo e adaptação para arquitetura 64 bits de versão do MrBayes para processamento paralelo.

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sexta-feira, 16 de julho de 2010

Bioinformática - Clustalw-MPI: Análise Filogenética utilizando computação paralela e distribuída

Por José Cleydson Ferreira da Silva
O software Clustalw-MPI é a ferramenta mais popular na implementação de múltiplo alinhamento de sequência de DNA. Sua principal diferença entre o software ClustalX dá-se a que ele possui uma melhor performance computacional devido realização do processamento em paralelo ou distribuído.

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quarta-feira, 14 de julho de 2010

Bioinformática - Análise Filogenética com Clustalx

O Clustalx é um software para o alinhamento de sequências nucleotídicas, peptídicas e analises filogênicas. O Clustalx é software semi-livre segundo a sua forma de licenciamento. Embora possua características de software livre como permissão de execução de programa, não há permissão de uso para fins comerciais.

Por José Cleydson Ferreira da Silva

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